|
|
İçerik
|
|
| 1. hafta: |
Giriş: Dersin orgaizasyonu.
“Bilgisayar Deneyi”nin tarihi gelişimi. |
| 2. hafta: |
Klasik istatistiksel mekanik yöntemleri.
En çok kullanılan istatistiksek topluluklar. |
| 3. hafta: |
Moleküler etkileşimler ve Kuvvet alanları. |
| 4. hafta: |
Temel termodinamik ve serbest enerji hesaplamaları.
Enerji minimizasyon yöntemleri.
Dönem proje konularının belirlenmesi |
| 5. hafta: |
Moleküler Dinamik yöntemine giriş. |
| 6. hafta: |
LAMMPS bilgisayar programına giriş
Ödev #1 (Moleküler Dinamik yönteminin uygulanması)
|
| 7. hafta: |
Monte Carlo yöntemine giriş. (Grand Canonical ve Gibbs toplulukları) |
| 8. hafta: |
Material Studio bilgisayar programına giriş.
Ödev #2 (Monte Carlo yönteminin uygulanması) |
| 9. hafta: |
Ara Sınav!!! |
| 10. hafta: |
Dengesizlik durumunda Moleküler Dinamik yöntemi
Saygın bir bilim insanın yayımlamış olduğu simülasyon çalışmasının incelenmesi.
|
| 11. hafta: |
Rosenbluth örneklendirmesi ve Configurational bias yöntemi.
Saygın bir bilim insanın yayımlamış olduğu simülasyon çalışmasının incelenmesi.
|
| 12. hafta: |
Moleküler simülasyon çalışmalarında nadiren karşılaşılan durumlar. |
| 13. hafta: |
Dağınık partikül dinamiği |
| 14. hafta: |
Dönem projelerinin sunumu!!! |
| 15. hafta*: |
Dersin genel değerlendirmesi |
| 16. hafta*: |
Final Sınavı!!! |
| Ders kitapları ve materyaller: |
D. Frenkel and B. Smit, Understanding Molecular Simulation: From Algorithms to Applications, 2nd Ed., Academic Pres, 2002. |
| Önerilen kaynaklar: |
1. M. Allen and D. Tildesley, Computer Simulation of Liquids, Oxford University Press, 1989.
2. A. Satoh, Introduction to Practice of Molecular Simulation, Elsevier Press, 2011.
3. M. J. Field, A Practical Introduction to the Simulation of Molecular Systems, Cambridge University Press, 2007. |
|
|
* 15. ve 16. haftalar arası final sınavına hazırlık haftası bulunmaktadır.
|
|
