ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE

Ders Bilgi Formu ( MBG 621 )


   Temel bilgiler
Ders adı: Prokaryotik Gen Ekspresyonu
Ders kodu: MBG 621
Öğretim üyesi: Prof. Dr. Sedef TUNCA GEDİK
AKTS kredisi: 7.5
GTÜ kredisi: 3 (3+0+0)
Yılı, Dönemi: 1/1, Güz ve Bahar
Dersin düzeyi: Yüksek lisans
Dersin tipi: Alan seçmeli
Öğretim dili: İngilizce
Öğretim şekli: Yüz yüze
Ön koşullar: Yok
Staj durumu: Yok
Dersin amacı: Bu dersin amacı prokaryotik gen yapısı, işlevi ve gen ekspresyonunun düzenlenmesine toplu bir bakış kazandırmaktır.
   Öğrenme çıktıları Yukarı

Bu dersi başarıyla tamamlayan öğrenciler, şu yetilere sahip olurlar:

  1. Prokaryotik gen yapısını ve işlevini kavrar.

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. İleri düzey Biyoloji kavramlarını tanımlamak ve uygulamak
    2. Hücre ve organizmalarda yapı-fonksiyon ilişkisini tanımlamak
    3. Bilimsel bilgiye ulaşmak ve bağımsız çalışmak
    4. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
  2. Prokaryotlarda DNA sentezi, transkripsiyon ve translasyon mekanizmaları hakkında detaylı bilgi sahibi olur.

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. İleri düzey Biyoloji kavramlarını tanımlamak ve uygulamak
    2. Bilimsel bilgiye ulaşmak ve bağımsız çalışmak
    3. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
    2. Ödev
  3. Prokaryotlarda gen ekspresyonunun nasıl düzenlendiğini anlatır.

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. İleri düzey Biyoloji kavramlarını tanımlamak ve uygulamak
    2. Bilimsel bilgiye ulaşmak ve bağımsız çalışmak
    3. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
    2. Ödev
   İçerik Yukarı
1. hafta: Prokaryotik hücreye genel bakış, hücre büyümesi ve hücre döngüsü
2. hafta: *DNA yapısı ve genetik bilgi
*Superkoiling ve histon benzeri proteinler
*Kromozomlar ve diğer genetik elementler
*Analytic methods in DNA and RNA research
3. hafta: *Prokaryotlarda DNA replikasyon mekanizması
*Ökaryotik DNA replikasyonuna özet bakış

4. hafta: *Prokaryotlarda transkripsiyon mekanizması
*Ökaryotik transkripsiyona özet bakış
5. hafta: *Prokaryotlarda translasyon mekanizması
6. hafta: *Ökaryotik translasyona özet bakış
*Genetik kod
*Protein katlanması ve salgılanması
*Molecular chaperones
7. hafta: *REGÜLASYON
*DNA-bağlanma proteinleri ve transkripsiyonel regülasyon
*‘Negatif kontrol’ ve ‘pozitif kontrol’
8. hafta: Vize sınavı ve değerlendirme
9. hafta: *Katabolit represyonu
*Sensing ve Sinyal iletimi
*Kuorum Sensing
*Isı şok proteinleri
*Sınırlandırılmış cevap
10. hafta: *Alternatif sigma faktörleri
*RNA'ya dayalı regülasyon
*Attenüasyon
11. hafta: *Translasyonun düzenlenmesi ve post-translasyonel modifikasyonlar
12. hafta: *DNA manipülasyonunda kullanılacak teknikler
*Moleküler klonlamanın esasları
*Mutasyon için moleküler metodlar
13. hafta: *Gen füzyonları ve reporter genler
*Klonlama vektörleri
*Klonlama vektörleri için uygun sistemler
*Shuttle Vectors
14. hafta: *Ekspresyon vektörleri
*Ekspresyon vektörlerinde transkripsiyonun regülasyonu
15. hafta*: *Genlerin bakteride ekspresyonu

16. hafta*: Final sınavı
Ders kitapları ve materyaller: PDF files covered in the lecture
Önerilen kaynaklar: 1. Watson, J.D., et al. Molecular Biology of the Gene. 7. ed. The Benjamin/Cummings Pub. Co., Menlo Park, California.
2. Madigan, M.T., Martinko, J.M., Bender, K.S., Buckley, D. H., Stahl, D.A. 15th Ed. Brock Biology of Microorganisims. Pearson Education Inc. San Francisco
3. Alberts, B., et al. Molecular Biology of the Cell. 3. ed. Garland Pub., New York, 1994.
4. Lewin, B. Genes VII. Oxford University Pres, Oxford, 2000.
5. Biology of the Prokaryotes, Lengeler, J., Schlegal, H. (Eds), 1999, Blackwell Publishing, Stutgart, Germany. 6. The World of the Cell, Becker, W.M., Kleinsmith, L.J., and Hardin, J.,2000, Addison Wesley Publishing Company, Masachusetts,U.S.A.
7. Wagner, R. Transcription Regulation in Prokaryotes. Oxford University Press, 2000.
  * 15. ve 16. haftalar arası final sınavına hazırlık haftası bulunmaktadır.
Değerlendirme Yukarı
Değerlendirme tipi Hafta numarası Ağırlık (%)
Ara sınavlar (Vizeler): 8 40
Dönem içi diğer çalışmalar: 0
Proje: 0
Ödev: 0
Kısa sınav (Quiz): 0
Final sınavı: 16 60
  Toplam ağırlık:
(%)
   İş yükü Yukarı
Etkinlik Süre (Haftalık saat) Toplam hafta sayısı Dönem boyu toplam iş yükü
Dersler (Yüz yüze öğretme): 3 15
Ders dışı bireysel çalışma: 4 15
Uygulama, Rehberli problem çözme: 0 0
Ödev: 0 0
Dönem projesi: 0 0
Dönem projesi sunumu: 0 0
Kısa sınav (Quiz): 0 0
Ara sınav için bireysel çalışma: 20 2
Ara sınav (Vize): 2 1
Final sınavı için bireysel çalışma: 20 2
Final sınavı: 2 1
    Toplam işyükü:
    Toplam AKTS kredisi:
*
  * AKTS kredisi, toplam iş yükünün 25'e bölümüdür. (1 AKTS = 25 saatlik iş yükü)
-->