ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE

Ders Bilgi Formu ( MBG 672 )


   Temel bilgiler
Ders adı: Mikrobiyal İkincil Metabolitler
Ders kodu: MBG 672
Öğretim üyesi: Prof. Dr. Sedef TUNCA GEDİK
AKTS kredisi: 7.5
GTÜ kredisi: 3 (3+0+0)
Yılı, Dönemi: 1/1, Güz
Dersin düzeyi: Yüksek lisans
Dersin tipi: Alan seçmeli
Öğretim dili: Türkçe
Öğretim şekli: Yüz yüze
Ön koşullar: YOK
Staj durumu: Yok
Dersin amacı: Bu derste mikroorganizmalar tarafından üretilen biyoaktif ikincil metabolitlerin çeşitleri, biyosentezleri ve regülasyonları ile ilgili ayrıntılı bilgiler verilecektir.
   Öğrenme çıktıları Yukarı

Bu dersi başarıyla tamamlayan öğrenciler, şu yetilere sahip olurlar:

  1. Mikroorganizmalar tarafından üretilen biyoaktif ikincil metabolitlerin çeşitleri hakkında bilgi sahibi olur.

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. İleri düzey Biyoloji kavramlarını tanımlamak ve uygulamak
    2. Araştırma projesi doğrultusunda literatürü dikkatlice gözden geçirip, kendi sonuçları ile önceki literatür arasında bağlantı kurmak
    3. Bilimsel bilgiye ulaşmak ve bağımsız çalışmak
    4. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak
    5. Tez çalışmaları için gerekli yeni araçların ve/veya yazılımların temel prensip ve uygulamalarını anlamak

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
  2. İkincil metabolitlerin nasıl sentezlendiklerini ve regüle edildiklerini tanır.

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. İleri düzey Biyoloji kavramlarını tanımlamak ve uygulamak
    2. Araştırma projesi doğrultusunda literatürü dikkatlice gözden geçirip, kendi sonuçları ile önceki literatür arasında bağlantı kurmak
    3. Bilimsel bilgiye ulaşmak ve bağımsız çalışmak
    4. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak

    Değerlendirme Tipi

    1. Laboratuvar uygulamaları/sınavları
  3. Biyoaktif ikincil metabolit üreten mikroorganizmaları izole eder.

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. İleri düzey Biyoloji kavramlarını tanımlamak ve uygulamak
    2. Araştırma projesi doğrultusunda literatürü dikkatlice gözden geçirip, kendi sonuçları ile önceki literatür arasında bağlantı kurmak
    3. Bilimsel bilgiye ulaşmak ve bağımsız çalışmak
    4. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
    2. Ödev
   İçerik Yukarı
1. hafta: Doğal ürünler, birincil ve ikincil metabolizma

2. hafta: Birincil metabolitler, İkincil metabolitler
3. hafta: Yeni biyoaktif metabolitlerin araştırılması
-Temel tarama metodolojileri
-Suş islahı ve yöntem geliştirme
-Biyolojik transformasyonlar
4. hafta: Antibiyotik üreten bazı mikroorganizmaların biyolojisi:
-Bacillus, Pseudomonas, Streptomyces, Streptoverticillium, Actinomycetes (other than Streptomyces, Myxobacteria, Aspergillus, Penicillium
5. hafta: Antibiyotik türleri ve etki mekanizmaları
-Makrolid antibiyotikleri
6. hafta: Antibiyotik türleri ve etki mekanizmaları
-Poliketid antibiyotikleri
7. hafta: Antibiyotik türleri ve etki mekanizmaları
-Aminoglikosid antibiyotikleri
-Beta-laktam antibiyotikleri
8. hafta: VİZE SINAVI ve değerlendirme
9. hafta: İkincil metabolitlerin biyosentezi
-Grup I Reaksiyonları: Birincil metabolitlerin biyosentetik ara ürünlere transformasyonu
-Grup II Reaksiyonları: Küçük metabolitlerin polimerizasyonu
-Grup III Reaksiyonları: Temel yapının modifikasyonu
10. hafta: İkincil metabolitlerin biyosentezinin regülasyonu
-Feedback regülasyonu
-Besin konsantrasyonu ile regülasyon
-Otoregülatörler ve pleiotrofik etkileyiciler
11. hafta: İkincil metabolitlerin biyosentezinin genetiği (Örnek: Antibiyotikler)
-Self-dirençlilik genleri
-Yapısal biyosentetik genler
12. hafta: İkincil metabolitlerin biyosentezinin genetiği (Örnek: Antibiyotikler)
-Regülasyondan sorumlu genler
13. hafta: İkincil metabolitlerin üretilmesi
-Suşların korunması ve saklanması
-Fermentasyon teknolojisi
14. hafta: Dersle ilgili güncel yayınların tartışması
15. hafta*: Dersle ilgili güncel yayınların tartışması
16. hafta*: FİNAL SINAVI
Ders kitapları ve materyaller: Derste işlenen PDF dosyaları ve güncel yayınlar
Önerilen kaynaklar: 1- Biosynthesis of Secondary Metabolites - Second Edition R.B. Herbert, Springer; 2 edition (2006)
2- Secondary-Metabolite Biosynthesis and Metabolism (Environmental Science Research) Richard J. Petroski, Susan P. McCormick, Springer; 1 edition (1992)
3- Biotechnology of Antibiotics and other Bioactive Microbial Metabolites G. Lancini, R. Lorenzetti, Springer; 1 edition (1993)
4- Secondary Metabolism (Oxford Chemistry Series) J. Mann, Oxford University Press, USA; 2 edition (1987)
  * 15. ve 16. haftalar arası final sınavına hazırlık haftası bulunmaktadır.
Değerlendirme Yukarı
Değerlendirme tipi Hafta numarası Ağırlık (%)
Ara sınavlar (Vizeler): 8 40
Dönem içi diğer çalışmalar: 0
Proje: 0
Ödev: 0
Kısa sınav (Quiz): 0
Final sınavı: 16 60
  Toplam ağırlık:
(%)
   İş yükü Yukarı
Etkinlik Süre (Haftalık saat) Toplam hafta sayısı Dönem boyu toplam iş yükü
Dersler (Yüz yüze öğretme): 3 15
Ders dışı bireysel çalışma: 4 15
Uygulama, Rehberli problem çözme: 0 0
Ödev: 0 0
Dönem projesi: 0 0
Dönem projesi sunumu: 0 0
Kısa sınav (Quiz): 0 0
Ara sınav için bireysel çalışma: 20 2
Ara sınav (Vize): 2 1
Final sınavı için bireysel çalışma: 20 2
Final sınavı: 2 1
    Toplam işyükü:
    Toplam AKTS kredisi:
*
  * AKTS kredisi, toplam iş yükünün 25'e bölümüdür. (1 AKTS = 25 saatlik iş yükü)
-->