ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE

Ders Bilgi Formu ( BTEC 654 )


   Temel bilgiler
Ders adı: Biyoteknoloji ve Tedavide Yenilikçi Multi-Omik
Ders kodu: BTEC 654
Öğretim üyesi: Dr. Öğr. Üyesi Hüseyin Çimen
AKTS kredisi: 7,5
GTÜ kredisi: 3 (3+0+0)
Yılı, Dönemi: 2024, Güz ve Bahar
Dersin düzeyi: Doktora
Dersin tipi: Alan seçmeli
Öğretim dili: İngilizce
Öğretim şekli: Yüz yüze
Ön koşullar: yok
Staj durumu: Yok
Dersin amacı: Biyoteknoloji ve tedavi alanındaki yenilikçi multiomikler dersi, öğrencilere biyoteknoloji ve tedavi alanlarında multiomik yaklaşımların gücünü kullanabilme bilgi ve becerilerini kazandırmayı hedefleyen güncel bir ders olarak tasarlanmıştır. Bu disiplinlerarası ders, genomik, proteomik, metabolomik ve diğer 'omik' disiplinlerinin entegrasyonunu inceleyerek biyolojik sistemlerin moleküler seviyede kapsamlı bir anlayışını sunar. Dersler ve gerçek örnekleriyle birleştirilerek öğrencilere multi-omik verilerini araştırma, geliştirme ve kişiselleştirilmiş tedavilerde kullanmayı öğrenmeleri sağlanmasi ve bu sayede, biyoteknolojik ve terapötik alanlarda hızla gelişen yenilenme ve ilerlemenin itici gücü olarak çok önemli bir rol oynamaları amaçlanmaktadır.
   Öğrenme çıktıları Yukarı

Bu dersi başarıyla tamamlayan öğrenciler, şu yetilere sahip olurlar:

  1. İlgili çalışma alanlarında çoklu omik platformunu dizayn ve entegre edebilme.

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. Biyoteknoloji alanında yeni bilgi ve teknikleri yüksek katma değerli ürünlere dönüştürebilmek
    2. Uzmanlaştığı biyoteknoloji alanı ile ilgili endüstriyel ve ticari faaliyetleri takip ederek sektör ile uyum içinde çalışabilmek
    3. Uzmanlaştığı biyoteknoloji alanı ile ilgili ulusal ve uluslararası mevzuata hakim olmak

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
  2. Biyolojik sistemlerde moleküler prensipleri öğrenebilme

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. Biyoteknoloji alanında uzmanlaşıp çalışabilmek için gerekli biyoloji temeline sahip olmak
    2. Sağlık biyoteknolojisi, bitki biyoteknolojisi, endüstriyel biyoteknoloji veya sentetik ve sistem biyoteknolojisi alanlarından birinde en üst düzeyde ve güncel bilgilere sahip olmak
    3. Giderek artan bilgi kirliliğinin farkında olarak güvenilir ve kaliteli bilgiyi ayırt edebilmek

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
  3. Omik ilişkili araştırma çalışmaların entegre edilerek kişiselleştirilmiş ilaç ürünlerine katkı sunabilme

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. Sağlık, tarım, gıda, çevre ve enerji gibi insan hayatı için kritik öneme sahip alanlardaki ihtiyaç ve sorunlara biyoteknolojinin sunduğu imkanlardan yararlanarak çözüm üretebilmek
    2. Biyoteknoloji alanında özgün Ar-Ge projeleri geliştirip yürütebilmek
    3. Küresel ölçekte hızla değişen şartlara adapte olarak ve yeni imkan ve teknolojilerden yararlanarak biyoteknoloji ile ilgili güncel gelişmeleri yakından takip edebilmek
    4. “Yaşam boyu öğrenme” yaklaşımını benimseyerek buna uygun alışkanlıklar geliştirmek
    5. Biyoteknoloji ile ilgili Türkçe ve İngilizce terminolojiye hakim olmak ve hem akademik ve bilimsel ortamlarda hem de iş dünyasında kendisini her iki dilde de çok iyi şekilde ifade edebilmek
    6. Uzmanlaştığı biyoteknoloji alanı ile ilgili ulusal ve uluslararası mevzuata hakim olmak
    7. Uzmanlaştığı biyoteknoloji alanına giren güncel akademik ve toplumsal tartışmalarda bilimsel gerçeklere dayanan ve güçlü fikirler beyan edebilecek nitelikte, saygın bir bilim insanı profili çizmek

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
   İçerik Yukarı
1. hafta: Multiomiklere giriş
2. hafta: Genomiks, proteomiks, ve metabolomiks temel ilkeleri
3. hafta: Veri toplama ve örnek hazırlama teknikleri
4. hafta: Yüksek hacimli dizi analizi, kütle spektrometri ve veri analizi
5. hafta: Genomik veri analizi ve yorumlanması
6. hafta: Transkriptomik ve gen ifade profilleme
7. hafta: Proteomik teknikleri ve veri analizi
Ara sınav
8. hafta: Metabolomik ve metabolik yol analiz
9. hafta: MultiOmik verilerin bütünleştirilmesi
10. hafta: Sistem biyoloji ve ağ analizi
11. hafta: İlaç keşfinde multiOmikler
12. hafta: Biyoteknoloji örnekleri
13. hafta: Kişiselleştirilmiş tıp ve klinik uygulamalar
14. hafta: MultiOmikleri kullanarak tedavi geliştirme ve yeni trendler
15. hafta*: Değerlendirme
16. hafta*: Final sınavı
Ders kitapları ve materyaller: Richard Twyman, Principles of Proteomics, Taylor & Francis
A. Malcolm Campbell, Laurie J. Heyer, Discovering Genomics, Proteomics and Bioinformatics, Benjamin Cummings
Önerilen kaynaklar: Edmond de Hoffmann, Vincent Stroobant, Mass Spectrometry: Principles and Application, Wiley-Interscience
  * 15. ve 16. haftalar arası final sınavına hazırlık haftası bulunmaktadır.
Değerlendirme Yukarı
Değerlendirme tipi Hafta numarası Ağırlık (%)
Ara sınavlar (Vizeler): 7 40
Dönem içi diğer çalışmalar: 0
Proje: 0
Ödev: 0
Kısa sınav (Quiz): 0
Final sınavı: 16 60
  Toplam ağırlık:
(%)
   İş yükü Yukarı
Etkinlik Süre (Haftalık saat) Toplam hafta sayısı Dönem boyu toplam iş yükü
Dersler (Yüz yüze öğretme): 3 14
Ders dışı bireysel çalışma: 5 16
Uygulama, Rehberli problem çözme: 0 0
Ödev: 0 0
Dönem projesi: 0 0
Dönem projesi sunumu: 0 0
Kısa sınav (Quiz): 0 0
Ara sınav için bireysel çalışma: 30 1
Ara sınav (Vize): 3 1
Final sınavı için bireysel çalışma: 30 1
Final sınavı: 3 1
    Toplam işyükü:
    Toplam AKTS kredisi:
*
  * AKTS kredisi, toplam iş yükünün 25'e bölümüdür. (1 AKTS = 25 saatlik iş yükü)
-->