Yer ve Deniz bilimleri Doktora programından doktora derecesi almak için, Gebze Teknik Üniversitesi Lisansüstü Eğitim-Öğretim Yönetmeliği’nin beşinci bölüm, kırkaltıncı maddesi uyarınca 21 krediden az olmamak koşulu ile en az 7 ders, 2 seminer dersi (kredisiz), 1 Araştırma Etiği dersi (kredisiz) ve öğrencinin yeterlilik sınavını geçtiği yarıyıldan itibaren her yarıyıl kendi tez danışmanınca açılan uzmanlık alan dersinin (tez dersi) alınması gerekir. Bu şartları sağlayan öğrenci tez çalışmasını tamamladıktan sonar jüri önünde tezini başarılı bir şekilde savunduktan sonar mezun olur.