• Temel bilgiler
• Öğrenme çıktıları
• İçerik
• Değerlendirme
• İş yükü

Öğrenme çıktıları

Bu dersi başarıyla tamamlayan öğrenciler, şu yetilere sahip olurlar:

1. 1. Çeşitli biyomoleküllerin yapılarını, fonksiyonlarını öğrenir, bu molekülleri bir arada tutan inter moleküler etkileşimlerin önemini ve çeşitlerini anlar.

   Program Çıktılarına Katkıları

   1. Başta biyoloji olmak üzere ilgili temel bilimlerde ve mühendislik alanlarında sağlam bir altyapıya sahip olmak
   2. Biyoteknolojide sektörün ihtiyaçlarını giderebilecek ve sorunlarını çözebilecek yaklaşımlar geliştirebilmek ve Ar-Ge faaliyetleri yürütebilmek

   Değerlendirme Tipi

   1. Yazılı sınav
   2. Ödev
2. 2. Protein katlanmasını öğrenerek, bu yapısal değişikliği izlemek için NMR ve EM gibi çeşitli tekniklerin çalışma prensiplerini öğrenir.

   Program Çıktılarına Katkıları

   1. Biyoteknolojide sektörün ihtiyaçlarını giderebilecek ve sorunlarını çözebilecek yaklaşımlar geliştirebilmek ve Ar-Ge faaliyetleri yürütebilmek
   2. Biyoteknoloji alanında girişimci olabilmek ve/veya yeni girişimlere gerek bilimsel ve teknik gerekse yönetsel katkı sağlayabilmek

   Değerlendirme Tipi

   1. Yazılı sınav
   2. Ödev
3. 3. Hücre zarı proteinlerinin ve enzimlerin işleyişini öğrenerek alosterik düzenlenme mekanzimalarını anlamak ve bu mekanizmaları öğrenir.

   Program Çıktılarına Katkıları

   1. Tez konusu ile ilgili biyoteknoloji alanında (sağlık biyoteknolojisi, bitki biyoteknolojisi, endüstriyel biyoteknoloji veya sentetik ve sistem biyoteknolojisi) üst düzey ve güncel bilgilere sahip olmak
   2. Sanayinin Ar-Ge faaliyetleri için gerekli teorik ve deneysel bilgi birikimine sahip olmak
   3. Biyoteknoloji alanında akademik dünya ile iş dünyası arasında köprü olabilmek ve üniversite-sanayi işbirliklerinin kurulup geliştirilmesini sağlayabilmek

   Değerlendirme Tipi

   1. Yazılı sınav
   2. Ödev
   3. Seminer/sunum
4. 4. Moleküler dinamik, yapı temelli ilaç dizaynı konusunda bilgi edinir, bazı yapısal temelli ilaç tekniklerini kendi deneyimler ve bu deneyimin sonunda doğru şekilde raporlamayı öğrenir.

   Program Çıktılarına Katkıları

   1. Sanayinin Ar-Ge faaliyetleri için gerekli teorik ve deneysel bilgi birikimine sahip olmak
   2. Biyoteknoloji alanında akademik dünya ile iş dünyası arasında köprü olabilmek ve üniversite-sanayi işbirliklerinin kurulup geliştirilmesini sağlayabilmek

   Değerlendirme Tipi

   1. Yazılı sınav
   2. Ödev
   3. Seminer/sunum
5. 5. Güncel literature doğru taramayı ve bunları okuyup, anlayıp, özümsemeyi öğrenerek, bu bilginin nasıl paylaşılacağını, sunulacağını deneyimler.

   Program Çıktılarına Katkıları

   1. Doğru ve güvenilir bilgiye ulaşmanın yollarını bilmek
   2. Biyoteknoloji alanında hem Türkçe’yi hem de İngilizce’yi üst düzeyde kullanabilmek

   Değerlendirme Tipi

   1. Yazılı sınav
   2. Ödev
   3. Seminer/sunum

İçerik
1. hafta:	İleri biyokimyaya giriş ve inter-moleküler etkileşimler
2. hafta:	Biyomoleküler yapılar ve fonksiyonları
3. hafta:	Protein katlanması
4. hafta:	Protein katlanmasını izlemek için teknikler Ödev 1
5. hafta:	Hücre zarı ve hücre zarı proteinleri
6. hafta:	Moleküler tanımlama ve bağlanma
7. hafta:	Protein-protein etkileşimleri ve alosteri
8. hafta:	Protein-protein etkileşimlerinin modülasyonu Ara Sınav
9. hafta:	NMR spektroskopi ve yapı tayini
10. hafta:	Elektron mikroskobu ve yapı tayini
11. hafta:	Alosterik hedefler: Enzimler Ödev 2
12. hafta:	Moleküler ve protein dinamiği
13. hafta:	Bilgisayar hesaplama temelli ilaç dizaynı uygulamaları Ödev 3
14. hafta:	Bilgisayar hesaplama temelli ilaç dizaynı uygulamaları sonuç raporlarının sunulması ve tartışması
15. hafta*:	Kritik konuların tekrarı
16. hafta*:	Final Sınavı
Ders kitapları ve materyaller:	The Molecules of Life Physical and chemical principles John Kuriyan, Boyana Konforti, David Wemmer Taylor and Francis
Önerilen kaynaklar:	Proteins: Structures and molecular properties Thomas E. Creighton, W. H. Freeman Wiley
	* 15. ve 16. haftalar arası final sınavına hazırlık haftası bulunmaktadır.

Değerlendirme
Değerlendirme tipi	Hafta numarası	Ağırlık (%)
Ara sınavlar (Vizeler):	8	40
Dönem içi diğer çalışmalar:	0	0
Proje:	0	0
Ödev:	4, 11, 13	20
Kısa sınav (Quiz):	0	0
Final sınavı:	16	40
	Toplam ağırlık:	(%)

İş yükü
Etkinlik	Süre (Haftalık saat)	Toplam hafta sayısı	Dönem boyu toplam iş yükü
Dersler (Yüz yüze öğretme):	3	14
Ders dışı bireysel çalışma:	5	14
Uygulama, Rehberli problem çözme:	1	3
Ödev:	7	3
Dönem projesi:	0	0
Dönem projesi sunumu:	0	0
Kısa sınav (Quiz):	0	0
Ara sınav için bireysel çalışma:	8	2
Ara sınav (Vize):	3	1
Final sınavı için bireysel çalışma:	10	3
Final sınavı:	3	1
		Toplam işyükü:
		Toplam AKTS kredisi:	*
	* AKTS kredisi, toplam iş yükünün 25'e bölümüdür. (1 AKTS = 25 saatlik iş yükü)