ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE

Syllabus ( BTEC 643 )


   Basic information
Course title: Molecular Pharmacology
Course code: BTEC 643
Lecturer: Assoc. Prof. Dr. Mehmet ÖZBİL
ECTS credits: 7,5
GTU credits: 3 (3+0+0)
Year, Semester: 2020-2021, Spring
Level of course: Third Cycle (Doctoral)
Type of course: Area Elective
Language of instruction: English
Mode of delivery: Face to face
Pre- and co-requisites: None
Professional practice: No
Purpose of the course: The aims of this course are to introduce students to pharmacology, pharmacodynamics/pharmacokinetics, drug targets, drug-target interactions at the molecular level, drug mechanisms, principles of computer-aided drug design and hands on experience with drug designing.
   Learning outcomes Up

Upon successful completion of this course, students will be able to:

  1. 1. Understand and demonstrate the basic chemical and biological knowledge that sets the basis for pharmacology at molecular level.

    Contribution to Program Outcomes

    1. Biyoteknoloji alanında uzmanlaşıp çalışabilmek için gerekli biyoloji temeline sahip olmak
    2. Biyoteknolojinin temel kavramlarını, kapsamını, uygulama alanlarını ve diğer bilim dallarıyla ilişkilerini bilmek
    3. Uzmanlaştığı biyoteknoloji alanı ile ilgili endüstriyel ve ticari faaliyetleri takip ederek sektör ile uyum içinde çalışabilmek

    Method of assessment

    1. Written exam
    2. Homework assignment
  2. 2. Demonstrate an understanding of pharmacokinetics and pharmacodynamics, mechanism of drug action, that will help to design novel drug molecules.

    Contribution to Program Outcomes

    1. Biyoteknoloji alanında yeni bilgi ve teknikleri yüksek katma değerli ürünlere dönüştürebilmek
    2. Biyoteknoloji alanında özgün Ar-Ge projeleri geliştirip yürütebilmek
    3. Uzmanlaştığı biyoteknoloji alanı ile ilgili uluslararası akademik çevrelerde ve iş dünyasında kendisine saygın bir yer edinerek üretken işbirlikleri kurabilecek sosyal becerilere sahip olmak

    Method of assessment

    1. Written exam
    2. Homework assignment
  3. 3. Meet with different drug targets and understand how a biomolecules becomes drug target, how to look for biomolecules, that can be targeted.

    Contribution to Program Outcomes

    1. Biyoteknoloji alanında başarılı bir girişimci olabilmek için gerekli temel bilgilere sahip olmak
    2. Biyoteknoloji alanında yeni bilgi ve teknikleri yüksek katma değerli ürünlere dönüştürebilmek
    3. Biyoteknoloji alanında özgün Ar-Ge projeleri geliştirip yürütebilmek

    Method of assessment

    1. Written exam
    2. Homework assignment
  4. 4. Acquire awareness on the next generation therapeutic techniques, understand the basis of pharmacogenomics and pharmacogenetics.

    Contribution to Program Outcomes

    1. Biyoteknolojinin temel kavramlarını, kapsamını, uygulama alanlarını ve diğer bilim dallarıyla ilişkilerini bilmek
    2. Biyoteknolojinin farklı alanlarında kullanılan başlıca yöntemlere hakim olmak
    3. Biyoteknoloji alanında özgün Ar-Ge projeleri geliştirip yürütebilmek
    4. Bilimsel toplantılar, sektör buluşmaları, eğitim toplantıları gibi farklı ortamların gereklerine uygun, etkileyici sunumlar yapabilmek

    Method of assessment

    1. Written exam
    2. Homework assignment
    3. Seminar/presentation
  5. 5. Demonstrate an understanding of computer aided drug design process, and apply some of the techniques on a hands-on experience, creating a scientific report on the findings.

    Contribution to Program Outcomes

    1. Küresel ölçekte hızla değişen şartlara adapte olarak ve yeni imkan ve teknolojilerden yararlanarak biyoteknoloji ile ilgili güncel gelişmeleri yakından takip edebilmek
    2. Biyoteknoloji ile ilgili Türkçe ve İngilizce terminolojiye hakim olmak ve hem akademik ve bilimsel ortamlarda hem de iş dünyasında kendisini her iki dilde de çok iyi şekilde ifade edebilmek
    3. Uzmanlaştığı biyoteknoloji alanı ile ilgili uluslararası akademik çevrelerde ve iş dünyasında kendisine saygın bir yer edinerek üretken işbirlikleri kurabilecek sosyal becerilere sahip olmak
    4. Uzmanlaştığı biyoteknoloji alanına giren güncel akademik ve toplumsal tartışmalarda bilimsel gerçeklere dayanan ve güçlü fikirler beyan edebilecek nitelikte, saygın bir bilim insanı profili çizmek

    Method of assessment

    1. Written exam
    2. Seminar/presentation
   Contents Up
Week 1: Introduction to pharmacology and drug targets
Week 2: Drug-receptor interactions: Quantitatively & qualitatively
Week 3: G protein coupled receptors
Week 4: Ion channels
Week 5: Transporter proteins
Homework 1
Week 6: Pharmacogenetics and personalized therapy
Week 7: Molecular signaling and signaling complexes
Week 8: Modulation of signaling complexes
Mid-term exam
Week 9: Drug absorption and drug metabolism
Week 10: Mechanisms of anti-infective drugs
Week 11: Clinical development of a new drug and methodology of drug trials
Homework 2
Week 12: Introduction to computer aided drug design
Week 13: Applications of computer aided drug design
Computer aided drug design workshop
Homework 3
Week 14: Presentations and discussions of computer aided drug design workshop
Week 15*: Review on critical topics
Week 16*: Final exam
Textbooks and materials: General and Molecular Pharmacology
Principles of Drug Action
Eds.: Francesco Clementi & Guido Fumagalli
Wiley
Recommended readings: Molecular Pharmacology, From DNA to Drug Discovery
John Dickenson, Fiona Freeman, Chris Lloyd Mills, Shiva Sivasubramaniam and Christian Thode
Wiley-Blackwell
  * Between 15th and 16th weeks is there a free week for students to prepare for final exam.
Assessment Up
Method of assessment Week number Weight (%)
Mid-terms: 8 40
Other in-term studies: 0 0
Project: 0 0
Homework: 5, 11, 13 20
Quiz: 0 0
Final exam: 16 40
  Total weight:
(%)
   Workload Up
Activity Duration (Hours per week) Total number of weeks Total hours in term
Courses (Face-to-face teaching): 3 14
Own studies outside class: 5 14
Practice, Recitation: 1 3
Homework: 7 3
Term project: 0 0
Term project presentation: 0 0
Quiz: 0 0
Own study for mid-term exam: 8 2
Mid-term: 3 1
Personal studies for final exam: 10 3
Final exam: 3 1
    Total workload:
    Total ECTS credits:
*
  * ECTS credit is calculated by dividing total workload by 25.
(1 ECTS = 25 work hours)
-->