Syllabus ( BTEC 654 )
|
|
Basic information
|
|
| Course title: |
Innovative MultiOmics in Biotechnology & Therapeutics |
| Course code: |
BTEC 654 |
| Lecturer: |
Assist. Prof. Hüseyin Çimen
|
| ECTS credits: |
7,5 |
| GTU credits: |
3 (3+0+0) |
| Year, Semester: |
2024, Fall and Spring |
| Level of course: |
Third Cycle (Doctoral) |
| Type of course: |
Area Elective
|
| Language of instruction: |
English
|
| Mode of delivery: |
Face to face
|
| Pre- and co-requisites: |
none |
| Professional practice: |
No |
| Purpose of the course: |
Innovative MultiOmics in Biotechnology & Therapeutics is a cutting-edge course designed to empower students with the knowledge and skills required to harness the power of multi-omics approaches in biotechnology and therapeutics. This interdisciplinary course will explore the integration of genomics, proteomics, metabolomics, and other 'omics' disciplines, offering a comprehensive understanding of biological systems at the molecular level. Through a combination of lectures and real-world case studies, students will learn how to leverage multi-omics data to advance research, development, and personalized therapies, driving innovation and progress in the rapidly evolving biotechnological and therapeutic landscapes. |
|
|
|
Learning outcomes
|
|
Upon successful completion of this course, students will be able to:
-
Design and integrate multiple omic platforms in related research fields.
Contribution to Program Outcomes
-
Biyoteknoloji alanında yeni bilgi ve teknikleri yüksek katma değerli ürünlere dönüştürebilmek
-
Uzmanlaştığı biyoteknoloji alanı ile ilgili endüstriyel ve ticari faaliyetleri takip ederek sektör ile uyum içinde çalışabilmek
-
Uzmanlaştığı biyoteknoloji alanı ile ilgili ulusal ve uluslararası mevzuata hakim olmak
Method of assessment
-
Written exam
-
Learn the molecular principles in biological systems
Contribution to Program Outcomes
-
Biyoteknoloji alanında uzmanlaşıp çalışabilmek için gerekli biyoloji temeline sahip olmak
-
Sağlık biyoteknolojisi, bitki biyoteknolojisi, endüstriyel biyoteknoloji veya sentetik ve sistem biyoteknolojisi alanlarından birinde en üst düzeyde ve güncel bilgilere sahip olmak
-
Giderek artan bilgi kirliliğinin farkında olarak güvenilir ve kaliteli bilgiyi ayırt edebilmek
Method of assessment
-
Written exam
-
Contribute the advancement of innovative products for personalized medicine through the integration of omics-related research
Contribution to Program Outcomes
-
Sağlık, tarım, gıda, çevre ve enerji gibi insan hayatı için kritik öneme sahip alanlardaki ihtiyaç ve sorunlara biyoteknolojinin sunduğu imkanlardan yararlanarak çözüm üretebilmek
-
Biyoteknoloji alanında özgün Ar-Ge projeleri geliştirip yürütebilmek
-
Küresel ölçekte hızla değişen şartlara adapte olarak ve yeni imkan ve teknolojilerden yararlanarak biyoteknoloji ile ilgili güncel gelişmeleri yakından takip edebilmek
-
“Yaşam boyu öğrenme” yaklaşımını benimseyerek buna uygun alışkanlıklar geliştirmek
-
Biyoteknoloji ile ilgili Türkçe ve İngilizce terminolojiye hakim olmak ve hem akademik ve bilimsel ortamlarda hem de iş dünyasında kendisini her iki dilde de çok iyi şekilde ifade edebilmek
-
Uzmanlaştığı biyoteknoloji alanı ile ilgili ulusal ve uluslararası mevzuata hakim olmak
-
Uzmanlaştığı biyoteknoloji alanına giren güncel akademik ve toplumsal tartışmalarda bilimsel gerçeklere dayanan ve güçlü fikirler beyan edebilecek nitelikte, saygın bir bilim insanı profili çizmek
Method of assessment
-
Written exam
|
|
|
Contents
|
|
| Week 1: |
Introduction to multiomics |
| Week 2: |
Fundamentals of genomics, proteomics, and metabolomics |
| Week 3: |
Techniques for data acquisition and sample preparation |
| Week 4: |
High-throughput sequencing, mass spectrometry, and data analysis |
| Week 5: |
Genomic data analysis and interpretation |
| Week 6: |
Transcriptomics and expression profiling |
| Week 7: |
Proteomic techniques and data analysis
Midterm exam
|
| Week 8: |
Metabolomics and metabolic pathway analysis |
| Week 9: |
Integration of multi-omics data |
| Week 10: |
Systems biology and network analysis |
| Week 11: |
MultiOmics in drug discovery |
| Week 12: |
Biotechnology case studies |
| Week 13: |
Personalized medicine and clinical applications |
| Week 14: |
Therapeutic development using multi-omics and emerging trends |
| Week 15*: |
Review |
| Week 16*: |
Final exam |
| Textbooks and materials: |
Richard Twyman, Principles of Proteomics, Taylor & Francis
A. Malcolm Campbell, Laurie J. Heyer, Discovering Genomics, Proteomics and Bioinformatics, Benjamin Cummings
|
| Recommended readings: |
Edmond de Hoffmann, Vincent Stroobant, Mass Spectrometry: Principles and Application, Wiley-Interscience |
|
|
* Between 15th and 16th weeks is there a free week for students to prepare for final exam.
|
|
|
|
|
Assessment
|
|
|
| Method of assessment |
Week number |
Weight (%) |
|
| Mid-terms: |
7 |
40 |
| Other in-term studies: |
|
0 |
| Project: |
|
0 |
| Homework: |
|
0 |
| Quiz: |
|
0 |
| Final exam: |
16 |
60 |
| |
Total weight: |
(%) |
|
|
|
|
Workload
|
|
|
| Activity |
Duration (Hours per week) |
Total number of weeks |
Total hours in term |
|
| Courses (Face-to-face teaching): |
3 |
14 |
|
| Own studies outside class: |
5 |
16 |
|
| Practice, Recitation: |
0 |
0 |
|
| Homework: |
0 |
0 |
|
| Term project: |
0 |
0 |
|
| Term project presentation: |
0 |
0 |
|
| Quiz: |
0 |
0 |
|
| Own study for mid-term exam: |
30 |
1 |
|
| Mid-term: |
3 |
1 |
|
| Personal studies for final exam: |
30 |
1 |
|
| Final exam: |
3 |
1 |
|
| |
|
Total workload: |
|
| |
|
Total ECTS credits: |
* |
|
|
* ECTS credit is calculated by dividing total workload by 25.
(1 ECTS = 25 work hours)
|
|
|
-->
