Ders bilgi formları arşivlenmiştir ve bilgi amaçlıdır. Güncel ders bilgi formlarına ulaşmak için Akademik Bilgi Sistemi'ni (https://obs.gtu.edu.tr/) ziyaret ediniz.

Course information packages are for archival purposes only. For up-to-date course information packages, please visit Academic Information System (https://obs.gtu.edu.tr/).

• Temel bilgiler
• Öğrenme çıktıları
• İçerik
• Değerlendirme
• İş yükü

Temel bilgiler
Ders adı:	Bakteri Metabolik Mühendisliği
Ders kodu:	KBRN 524
Öğretim üyesi:	Doç. Dr. F. İnci ÖZDEMİR
AKTS kredisi:	7.5
GTÜ kredisi:	3 (3+0+0)
Yılı, Dönemi:	1, Bahar
Dersin düzeyi:	Yüksek lisans
Dersin tipi:	Alan seçmeli
Öğretim dili:	Türkçe
Öğretim şekli:	Yüz yüze
Ön koşullar:	none
Staj durumu:	Yok
Dersin amacı:	Bakteri hücerisinin yapısını besin alışverisi hakkında bilgi vermek. Bakterilerdeki temel metabolik yolakları anlamak ve metabolik yolakların düzenlenmesi hakkında bakış açısı sağlamak.

Öğrenme çıktıları

Bu dersi başarıyla tamamlayan öğrenciler, şu yetilere sahip olurlar:

1. Sınıf tartışmalarına katılım, ödev hazırlama ve sözlü sunumlar yoluyla mikrobiyal fizyolojide (hücre yapısı, büyüme, biyosentez, ulaşım, vb.) seçilen konularda ileri düzeyde bir bakış açısı kazanırlar.

   Program Çıktılarına Katkıları

   1. Kendi bulgularını diğerleri ile birlikte detaylı bir şekilde analiz edip, değerlendirebilmek
   2. Orijinal, bağımsız ve kritik düşünme becerisi kazanıp teorik kavram ve araçlar geliştirmek
   3. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak
   4. Araştırma konusu ile ilgili fikir ve bulgularını sözlü ve yazılı olarak etkin şekilde ifade edebilmek

   Değerlendirme Tipi

   1. Ödev
   2. Seminer/sunum
2. Mikroorganizma metabolizmasında enerji üreten ve tüketen reaksiyonların prensiplerini kavrar.

   Program Çıktılarına Katkıları

   1. Sorgulayıcı, yenilikçi yaklaşımlar ortaya koymak
   2. Orijinal, bağımsız ve kritik düşünme becerisi kazanıp teorik kavram ve araçlar geliştirmek
   3. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak
   4. İlgili sağlık ve güvenlik konularını anlamak ve çalışmalarında sorumluluk sergilemek

   Değerlendirme Tipi

   1. Yazılı sınav
   2. Ödev
   3. Seminer/sunum
3. Mikroorganizmalardaki çeşitli katabolik ve anabolik yolakları, transport sistemlerini ve enerji tasarruf mekanizmalarını kavrar ve açıklar.

   Program Çıktılarına Katkıları

   1. Kimyasal, Biyolojik, Radyolojik ve Nükleer (KBRN) kavramlarını uzmanlık derecesinde açıklamak ve KBRN savunmasında uygulamak
   2. Sorgulayıcı, yenilikçi yaklaşımlar ortaya koymak
   3. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak
   4. İlgili sağlık ve güvenlik konularını anlamak ve çalışmalarında sorumluluk sergilemek

   Değerlendirme Tipi

   1. Yazılı sınav
   2. Ödev

İçerik
1. hafta:	Prokaryotik hücre yapısına genel bakış
2. hafta:	Bakteriyel sitoplazmik membran I: Fosfolipid yapısı, enerjilenmiş membran, solunum zinciri proteinleri
3. hafta:	Bakteriyel sitoplazmik membran II: Protein translokasyonu, sinyal iletimi, kemotaksi ve motilite
4. hafta:	Bakteriyel sitoplazmik membran III: DNA sentezi ve hücre bölünmesi
5. hafta:	Substrat alınımlarının farklı mekanizması: Pasif difüzyon, kolaylaştırılmış difüzyon, aktif nakil, grup translokasyonu
6. hafta:	Ara sınav I
7. hafta:	Enerji reaksiyonları I: Glikoliz, fermentatif yollar
8. hafta:	Enerji reaksiyonları II: Glikoliz, Aerobik oksidasyon ve fotosentez
9. hafta:	Enerji reaksiyonları III: Anaerobik solunumlar, biyosentetik reaksiyonlar
10. hafta:	Metabolik yolların regülasyonu I: Enzim aktivitesinin düzenlenmesi, enzim konsantrasyonu
11. hafta:	Ara sınav II
12. hafta:	Metabolik yolların regülasyonu II: Transkripsiyon başlangıcının kontrolü, Translasyon kontrolü
13. hafta:	Metabolik yolların regülasyonu III: Tüm basamaklarda ve metabolik yolun düzenlenmesi
14. hafta:	Öğrenci Sunumlar I
15. hafta*:	Genel değerlendirme
16. hafta*:	Final Sınavı
Ders kitapları ve materyaller:	Gerhard Gottschalk "Bacteria Metabolism" Springer Science & Business Media, Dec 6, 2012. Larry Barton "Structural and Functional Relationships in Prokaryotes" Springer Science & Business Media, 2005.
Önerilen kaynaklar:	Wolfgang Eisenreich, Jürgen Heesemann, Thomas Rudel and Werner Goebel “Metabolic host responses to infection by intracellular bacterial pathogens” Front. Cell. Infect. Microbiol., 09 July. Joel H Weiner, Damaraju Sambasivarao, Richard A Rothery “Bacterial Cytoplasmic Membrane” Encyclopedıa of Life Sciences © 2001. Kazuyuki Shimizu” Metabolic Regulation of a Bacterial Cell System with Emphasis on Escherichia coli “, ISRN Biochemistry, Volume 2013,p.47
	* 15. ve 16. haftalar arası final sınavına hazırlık haftası bulunmaktadır.

Değerlendirme
Değerlendirme tipi	Hafta numarası	Ağırlık (%)
Ara sınavlar (Vizeler):	6,11	25
Dönem içi diğer çalışmalar:	0	0
Proje:	14	25
Ödev:	15	10
Kısa sınav (Quiz):	0	0
Final sınavı:	16	40
	Toplam ağırlık:	(%)

İş yükü
Etkinlik	Süre (Haftalık saat)	Toplam hafta sayısı	Dönem boyu toplam iş yükü
Dersler (Yüz yüze öğretme):	3	14
Ders dışı bireysel çalışma:	3	14
Uygulama, Rehberli problem çözme:	0	0
Ödev:	2	1
Dönem projesi:	1	1
Dönem projesi sunumu:	1	1
Kısa sınav (Quiz):	0	0
Ara sınav için bireysel çalışma:	10	3
Ara sınav (Vize):	3	10
Final sınavı için bireysel çalışma:	10	4
Final sınavı:	2	1
		Toplam işyükü:
		Toplam AKTS kredisi:	*
	* AKTS kredisi, toplam iş yükünün 25'e bölümüdür. (1 AKTS = 25 saatlik iş yükü)