ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE

Ders Bilgi Formu ( MBG 427 )


   Temel bilgiler
Ders adı: Organel Dinamiği
Ders kodu: MBG 427
Öğretim üyesi: Dr. Merve TUZLAKOĞLU ÖZTÜRK
AKTS kredisi: 5
GTÜ kredisi: 3 ()
Yılı, Dönemi: 2025, Güz
Dersin düzeyi: Lisans
Dersin tipi: Bölüm seçmeli
Öğretim dili: İngilizce
Öğretim şekli: Yüz yüze
Ön koşullar: "yok"
Staj durumu: Yok
Dersin amacı: Dersin Amacı Dersin temel amacı, son yıllarda modern hücre biyolojisinin ilgi odağı olan zarla çevrili organellerin yanı sıra zarsız organellerin yapısı ve oluşumuyla ilgili biyolojik süreçleri tanıtmaktır.
Membran içermeyen organellerin kanser, kardiyovasküler hastalıklar, amiloidoz, nörodejeneratif hastalıklar, diyabet ve genetik hastalıklar gibi çeşitli insan hastalıklarına neden olduğu mekanizmaların aydınlatılmasındaki son gelişmeleri tanımlamaktır.
   Öğrenme çıktıları Yukarı

Bu dersi başarıyla tamamlayan öğrenciler, şu yetilere sahip olurlar:

  1. Hücre içinde zarla çevrili olmayan organelleri tanımlayabilme.

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. Moleküler Biyoloji ve Genetik ile ilgili genel kavramları ve problemleri tanımlama ve çözüm yolları üretebilme.
    2. Hücre ve organizmalarda yapı-fonksiyon ilişkisini moleküler düzeyde tanımlayabilme.
    3. Bireysel olarak çalışabilmek, bağımsız karar alabilmek ve farklı disiplinleri de içeren grup çalışmalarına etkin olarak katılabilme.
    4. Sürekli öğrenme bilinciyle bilimsel ve teknolojik yenilikleri takip ederek alanına uygulayabilme.
    5. Mevcut bilgiyi kullanarak hipotez üretebilmek ve problem çözümüne yönelik deney tasarlayıp yürüterek elde edilen sonuçları yorumlayabilme.

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
    2. Seminer/sunum
  2. Zarsız organelleri oluşturan mekanizmaları kavrayabilme.

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. Moleküler Biyoloji ve Genetik ile ilgili genel kavramları ve problemleri tanımlama ve çözüm yolları üretebilme.
    2. Hücre ve organizmalarda yapı-fonksiyon ilişkisini moleküler düzeyde tanımlayabilme.
    3. Bireysel olarak çalışabilmek, bağımsız karar alabilmek ve farklı disiplinleri de içeren grup çalışmalarına etkin olarak katılabilme.
    4. Sürekli öğrenme bilinciyle bilimsel ve teknolojik yenilikleri takip ederek alanına uygulayabilme.
    5. Mevcut bilgiyi kullanarak hipotez üretebilmek ve problem çözümüne yönelik deney tasarlayıp yürüterek elde edilen sonuçları yorumlayabilme.

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
    2. Seminer/sunum
  3. Membransız organellerin oluşum dinamikleri ve hastalıkları arasındaki ilişkiyi yorumlayabilme.

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. Moleküler Biyoloji ve Genetik ile ilgili genel kavramları ve problemleri tanımlama ve çözüm yolları üretebilme.
    2. Hücre ve organizmalarda yapı-fonksiyon ilişkisini moleküler düzeyde tanımlayabilme.
    3. Bireysel olarak çalışabilmek, bağımsız karar alabilmek ve farklı disiplinleri de içeren grup çalışmalarına etkin olarak katılabilme.
    4. Sürekli öğrenme bilinciyle bilimsel ve teknolojik yenilikleri takip ederek alanına uygulayabilme.
    5. Mevcut bilgiyi kullanarak hipotez üretebilmek ve problem çözümüne yönelik deney tasarlayıp yürüterek elde edilen sonuçları yorumlayabilme.

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
    2. Seminer/sunum
   İçerik Yukarı
1. hafta: Zarla çevrili organeller
2. hafta: Sıvı-sıvı faz ayrımına giriş (LLPS)-Biyomoleküler kondensatlar
3. hafta: Zarsız nükleer organeller-1 (Nükleer benekler, paraspeküller, nükleuslar)
4. hafta: Zarsız nükleer organeller-1 (Nükleer stres cisimciği, Cajal cisimciği, germ granülü, PML cisimciği)
5. hafta: Ribozomlar
6. hafta: P-granülleri 1

7. hafta: Ara Sınav-P-granülleri 2
8. hafta: Stres granülleri
9. hafta: Membransız organellerin modülatörleri
10. hafta: Mikrobiyal hücrelerde LLPS
11. hafta: LLPS'yi incelemek için kullanılan teknikler ve yöntemler
12. hafta: Sıvı-sıvı faz ayrımına ilişkin hücresel çalışmalar
13. hafta: Zarsız organellerin hastalıklardaki rolü
14. hafta: Genel tekrar
15. hafta*: -
16. hafta*: Final sınavı
Ders kitapları ve materyaller: 1. Functionally Relevant Macromolecular Interactions of Disordered Proteins;ISBN 978-3-03936-521-0; 2020
2. Intrinsically Disordered Proteins and Chronic Diseases; ISBN978-3-0365-1263-1; 2021
Önerilen kaynaklar: Alberti S, Carra S. Quality Control of Membraneless Organelles. J Mol Biol. 2018 Nov 2;430(23):4711-4729. doi: 10.1016/j.jmb.2018.05.013. Epub 2018 May 11. PMID: 29758260.
  * 15. ve 16. haftalar arası final sınavına hazırlık haftası bulunmaktadır.
Değerlendirme Yukarı
Değerlendirme tipi Hafta numarası Ağırlık (%)
Ara sınavlar (Vizeler): 7 40
Dönem içi diğer çalışmalar: 0
Proje: 0
Ödev: 0
Kısa sınav (Quiz): 0
Final sınavı: 16 60
  Toplam ağırlık:
(%)
   İş yükü Yukarı
Etkinlik Süre (Haftalık saat) Toplam hafta sayısı Dönem boyu toplam iş yükü
Dersler (Yüz yüze öğretme): 3 14
Ders dışı bireysel çalışma: 3 14
Uygulama, Rehberli problem çözme: 0 0
Ödev: 0 0
Dönem projesi: 0 0
Dönem projesi sunumu: 0 0
Kısa sınav (Quiz): 0 0
Ara sınav için bireysel çalışma: 2 7
Ara sınav (Vize): 2 1
Final sınavı için bireysel çalışma: 3 9
Final sınavı: 2 1
    Toplam işyükü:
    Toplam AKTS kredisi:
*
  * AKTS kredisi, toplam iş yükünün 25'e bölümüdür. (1 AKTS = 25 saatlik iş yükü)
-->