ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE

Ders Bilgi Formu ( MBG 543 )


   Temel bilgiler
Ders adı: Deniz Biyoteknolojisi
Ders kodu: MBG 543
Öğretim üyesi: Dr. Öğr. Üyesi Sonay ÖZKAN
AKTS kredisi: 7.5
GTÜ kredisi: 3 (3+0+0)
Yılı, Dönemi: 1/2, Güz ve Bahar
Dersin düzeyi: Yüksek lisans
Dersin tipi: Alan seçmeli
Öğretim dili: İngilizce
Öğretim şekli: Yüz yüze
Ön koşullar: yok
Staj durumu: Yok
Dersin amacı: Deniz canlılarındaki ticari öneme sahip bileşikler ve kullanım alanlarını öğretmek.
Deniz canlılarının tıpta, eczacılıkta ve çeşitli biyoteknolojik alanlarda kullanımını anlatmak
Deniz farmakolojisinde, özellikle Alzheimer, osteoporoz, tüberküloz, malaria gibi hastalıkların tedavisinde kullanılan potansiyel deniz ürünü bileşiklerini tanıtmak.
Deniz ürünü alerjenlerinin moleküler biyolojisi anlatmak.
Krustase ve balıkların üreme biyoteknolojisi hakkında bilgilendirmek
   Öğrenme çıktıları Yukarı

Bu dersi başarıyla tamamlayan öğrenciler, şu yetilere sahip olurlar:

  1. Deniz canlılarını, onlardan elde edilen kimyasal bileşikleri, bu bileşiklerin biyoteknolojik önemini tanımlamak.

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. İleri düzey Biyoloji kavramlarını tanımlamak ve uygulamak
    2. Genetik ve protein mühendisliği, mikrobik tanımlama, enzim teknolojileri, memeli hücre kültürü ve bitki doku kültüründe kullanılan teknikleri bilmek ve uygulamak
    3. Bilimsel bilgiye ulaşmak ve bağımsız çalışmak
    4. Disiplinlerarası etkileşim bulunan araştırma takımlarında etkin şekilde çalışmak
    5. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak
    6. Araştırma konusu ile ilgili fikir ve bulgularını sözlü ve yazılı olarak etkin şekilde ifade edebilmek
    7. Profesyonel ve etik davranış sorumluluğu sergilemek

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
  2. Deniz farmokolojisinde kullanılan kimyasal bileşikleri listelemek ve hangi bileşiğin hangi hastalık tedavisinde veya biyoteknolojide kullanabileceğini tanımlamak.

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. İleri düzey Biyoloji kavramlarını tanımlamak ve uygulamak
    2. Hücre ve organizmalarda yapı-fonksiyon ilişkisini tanımlamak
    3. Genetik ve protein mühendisliği, mikrobik tanımlama, enzim teknolojileri, memeli hücre kültürü ve bitki doku kültüründe kullanılan teknikleri bilmek ve uygulamak
    4. Disiplinlerarası etkileşim bulunan araştırma takımlarında etkin şekilde çalışmak
    5. Tez çalışmaları için gerekli yeni araçların ve/veya yazılımların temel prensip ve uygulamalarını anlamak
    6. Araştırma konusu ile ilgili fikir ve bulgularını sözlü ve yazılı olarak etkin şekilde ifade edebilmek
    7. Biyolojik kavramları bireysel, sosyal, ekonomik, teknolojik ve etik konulara uygulamak

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
    2. Ödev
  3. Kültüre alınan deniz canlılarını listelemek, hangi canlıdan hangi kimyasal bileşiklerin sentez edileceğini kavramak

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. İleri düzey Biyoloji kavramlarını tanımlamak ve uygulamak
    2. Genetik ve protein mühendisliği, mikrobik tanımlama, enzim teknolojileri, memeli hücre kültürü ve bitki doku kültüründe kullanılan teknikleri bilmek ve uygulamak
    3. Bilimsel bilgiye ulaşmak ve bağımsız çalışmak
    4. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak
    5. Tez çalışmaları için gerekli yeni araçların ve/veya yazılımların temel prensip ve uygulamalarını anlamak
    6. Araştırma konusu ile ilgili fikir ve bulgularını sözlü ve yazılı olarak etkin şekilde ifade edebilmek
    7. Biyolojik kavramları bireysel, sosyal, ekonomik, teknolojik ve etik konulara uygulamak

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
  4. Deniz biyoteknolojisinde kullanılan yöntemleri uygulamak

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. İleri düzey Biyoloji kavramlarını tanımlamak ve uygulamak
    2. Genetik ve protein mühendisliği, mikrobik tanımlama, enzim teknolojileri, memeli hücre kültürü ve bitki doku kültüründe kullanılan teknikleri bilmek ve uygulamak
    3. Bilimsel bilgiye ulaşmak ve bağımsız çalışmak
    4. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak
    5. Tez çalışmaları için gerekli yeni araçların ve/veya yazılımların temel prensip ve uygulamalarını anlamak
    6. Araştırma konusu ile ilgili fikir ve bulgularını sözlü ve yazılı olarak etkin şekilde ifade edebilmek
    7. Biyolojik kavramları bireysel, sosyal, ekonomik, teknolojik ve etik konulara uygulamak

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
    2. Ödev
   İçerik Yukarı
1. hafta: Deniz mikroorganizmalarındaki yeni metabolitlerin taranması.
Deniz mikroorganizma genomlarının dizi analizleri, tamamlanmış ve devam eden deniz dizi analizi projeleri.
Deniz mikroorganizmalarından metabolitlere örnekler. Hedeflenen antibakteriyal bileşiklerin analizleri için proteomiksteki uygulamalar.
2. hafta: Deniz organizmaları lipidlerindeki yağ asitleri.
Moleküler biyo-çeşitlilik, biyo-markırların rolleri, biyolojik aktif bileşikler ve ekonomik önemi.
Doymamış yağ asitlerine ticari ilgi.
3. hafta: Atık balık ve kabukluların geri dönüşümü ve değerlendirilmesi.
Balık ve kabuklulardaki hidrolizatlar ve son gelişmeler.
4. hafta: Deniz mikroalglerinden faydalı kimyasalların üretimi ve metabolik mühendisliği.
Deniz mikroalglerinin tüm genomlarının analizleri.
Mikroalgleri kültüre alma teknikleri.
5. hafta: Deniz enzimleri.
Aşırı ortam canlıları (extremophiles), simbiyotik deniz mikroorganizmaları, deniz suyu ve sedimentinde yaşayan mikroorganizmalar.
Biyolojik çeşitliliğin saptanmasında moleküler metodlar.
6. hafta: Yeni biyokatalistler ve mikroorganizma içeren aşırı ortamlar.
Düşük ve yüksek sıcaklığa adapte olabilen mikroorganizmalar.
Aşırı asidik ortamlarda yaşayabilen canlılar.
Yüksek tuz konsantrasyonuna toleranslı mikroorganizmalar.
7. hafta: Gıda olmayan deniz organizmalarının kültürü.
Antifouling teknolojileri.
8. hafta: Ara Sınav
9. hafta: Deniz mantar ve prokaryotlarının kültüre alınmasındaki biyolojik prosesler hakkındaki veriler.
Deniz mezofilik bakteri ve mantarları üzerine biyoproses mühendisliği verileri.
Deniz hipertermofilik ve barofilik Archaea üzerine biyoproses mühendisliği verileri.
10. hafta: Deniz biyoteknolojisinde işleme prosesleri.
Genel işleme teknolojileri.
Enzimlerin saflaştırılması ve izolasyonu.
Oligo ve polisakkaritlerin işlenmesi.
Kitin ve kitozanların saflaştırılması ve izolasyonu.
Fukoidan ve fukoidanazların izolasyonu.
Doymamış yağ asitlerinin işlenmesi.
Düşük moleküler ağırlıkta olan biyoaktif bileşiklerin işlenmesi.
11. hafta: Deniz farmakolojisi.
Alzheimer’s hastalığı, osteoporoz ve enfeksiyon hastalıklarının tedavisinde potansiyeller.
Deniz orijinli antitüberküloz ajanlar.
Yeni antimalariyan ajanların kaynağı olarak deniz doğal ürünleri.
Potansiyel antiosteoporoz ajan olarak zoantamin familyası.
Alzheimer’s hastalığını tedavinde ümit veren ajan.
12. hafta: Karmaşık deniz doğal ürünlerinin asimetrik total sentezi.
Seçilmiş sentezlere örnekler.
13. hafta: Deniz ürünü alerjisine giriş.
Gıda alerjisi ve toplum.
Gıda alerjisinde diyagnozlar.
Deniz ürünü alerjenlerinin moleküler biyolojisi.
Uygulamalar ve gelecekte atılacak adımlar.
14. hafta: Krustase ve balıkların üreme biyoteknolojisi.
Balıklarda gen transferi metodları.
Transjenik balıkların üretimi.
Deniz kabukluları ve balıklara gen transferi.
Balık soylarının gelişimi.
Çevresel ksenobiyotiklerin tespiti için transjenik balık modelleri.
15. hafta*: Etik ve akuatik biyoteknolojinin geleceği
16. hafta*: Final sınavı
Ders kitapları ve materyaller: Marine Biotechnology handouts
Önerilen kaynaklar: 1. Marine Biotechnology I. Advances in Biochemical Engineering /Biotechnology 96. Springer. Volume editors: Y. Le Gal and R. Ulber
2. Marine Biotechnology II. Advances in Biochemical Engineering /Biotechnology 97. Springer. Volume editors: Y. Le Gal and R. Ulber.
3. Biotechnology of Aquatic Animals. Editors: R. Nagabhushanam, A.D. Diwan, B.J. Zahuranec, R. Sarojini.
  * 15. ve 16. haftalar arası final sınavına hazırlık haftası bulunmaktadır.
Değerlendirme Yukarı
Değerlendirme tipi Hafta numarası Ağırlık (%)
Ara sınavlar (Vizeler): 8 50
Dönem içi diğer çalışmalar: 0
Proje: 0
Ödev: 0
Kısa sınav (Quiz): 0
Final sınavı: 16 50
  Toplam ağırlık:
(%)
   İş yükü Yukarı
Etkinlik Süre (Haftalık saat) Toplam hafta sayısı Dönem boyu toplam iş yükü
Dersler (Yüz yüze öğretme): 3 14
Ders dışı bireysel çalışma: 4 14
Uygulama, Rehberli problem çözme: 0 0
Ödev: 6 14
Dönem projesi: 0 0
Dönem projesi sunumu: 0 0
Kısa sınav (Quiz): 0 0
Ara sınav için bireysel çalışma: 0 0
Ara sınav (Vize): 3 1
Final sınavı için bireysel çalışma: 0 0
Final sınavı: 3 1
    Toplam işyükü:
    Toplam AKTS kredisi:
*
  * AKTS kredisi, toplam iş yükünün 25'e bölümüdür. (1 AKTS = 25 saatlik iş yükü)
-->