ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE ECTS @ IUE

Ders Bilgi Formu ( MBG 572 )


   Temel bilgiler
Ders adı: Bakteriyel Ekoloji
Ders kodu: MBG 572
Öğretim üyesi: Dr. Öğr. Üyesi Sonay ÖZKAN
AKTS kredisi: 7.5
GTÜ kredisi: 3 (3+0+0)
Yılı, Dönemi: 1/2, Güz ve Bahar
Dersin düzeyi: Yüksek lisans
Dersin tipi: Alan seçmeli
Öğretim dili: Türkçe
Öğretim şekli: Yüz yüze
Ön koşullar: Yok
Staj durumu: Yok
Dersin amacı: Öğrencilere bakteri ekolojisi, bakteri sınıflandırılmasını, izolasyonunu ve kültüre alınması hakkında bilgi vermek ve bakterilerin ortamları hakkındaki bilgileri gelecek araştımalarında kullanma yetisi kazandırmak
   Öğrenme çıktıları Yukarı

Bu dersi başarıyla tamamlayan öğrenciler, şu yetilere sahip olurlar:

  1. Bakterilerin tanımını, sınıflandırmasını, morfolojisini ve kimyasal özelliklerini ayırmak

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. İleri düzey Biyoloji kavramlarını tanımlamak ve uygulamak
    2. Bilimsel bilgiye ulaşmak ve bağımsız çalışmak
    3. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak
    4. Tez çalışmaları için gerekli yeni araçların ve/veya yazılımların temel prensip ve uygulamalarını anlamak
    5. Ülkedeki biyolojik çeşitliliğin tanımlanması, kullanılması ve sürdürülmesinin önemini anlamak

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
  2. Hangi bakterinin hangi hastalığa neden olduğunu listelemek

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. İleri düzey Biyoloji kavramlarını tanımlamak ve uygulamak
    2. Bilimsel bilgiye ulaşmak ve bağımsız çalışmak
    3. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak
    4. Tez çalışmaları için gerekli yeni araçların ve/veya yazılımların temel prensip ve uygulamalarını anlamak
    5. Ülkedeki biyolojik çeşitliliğin tanımlanması, kullanılması ve sürdürülmesinin önemini anlamak

    Değerlendirme Tipi

    1. Yazılı sınav
  3. Bakterilerin ekolojik ortamlarını üreme ve kültür koşullarını deneysel çalışmalara uyarlamak

    Program Çıktılarına Katkıları

    1. İleri düzey Biyoloji kavramlarını tanımlamak ve uygulamak
    2. Bilimsel bilgiye ulaşmak ve bağımsız çalışmak
    3. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak
    4. Tez çalışmaları için gerekli yeni araçların ve/veya yazılımların temel prensip ve uygulamalarını anlamak
    5. Ülkedeki biyolojik çeşitliliğin tanımlanması, kullanılması ve sürdürülmesinin önemini anlamak

    Değerlendirme Tipi

    1. Laboratuvar uygulamaları/sınavları
   İçerik Yukarı
1. hafta: Bakteri Ekolojisine Giriş. Terimler ve Tanımları. Biyomlar. Jeolojik Zamanlarda Organizmaların Ortaya Çıkışı. Bakteri ve Archaea Ekolojisine Giriş. Mikroorganizmaların besin tiplerine göre sınıflandırılması. Prokaryotların çevre koşullarına cevaplarına göre sınıflandırılışı. Simbiyozis. Bakteriyel Patojenlik.
2. hafta: Archeae: Metanojenler (Methanogens). Aşırı halofiller. Aşırı termofiller.
3. hafta: Bakteriler: Fotosentetik Eflatun ve Yeşil Bakteriler. Siyanobakteriler, Spiroketler. Spirilla. Miksobakteriler (Myxobacteria). Litotroflar. Pseudomonadlar. Enterik Bakteriler. Vibrio. Nitrojen Fiske Edebilen Bakteriler. Piyojenik Kokuslar. Endospor Oluşturan Bakteriler. Aktinomiçestes ve ilgili bakteriler. Riketsiya ve Clamidiya. Mikoplazmalar (Mycoplasma) Fitopatojenler.
4. hafta: Bitki Bakterileri: Agrobacterium, Coryneform bakteriler, Erwinia, Pseudomonadaceae.
5. hafta: Havadan Kökenlenmiş (Air-borne) Patojenler
İnsan Florasında Bulunan Bakteriler. Dental Plaque, diş çürükleri ve peridontal hastalıklar. Gastrointestinal yolların normal florası. Genito-üriner Enfeksiyonlara Neden Olan Bakteriler. Hayvan Kökenli (vector-borne) patojenler.
6. hafta: Doğal Su Kaynaklarındaki Bakteriler. Tatlı Sularda Yaşayan Prokaryotların Biyoekolojisi.
7. hafta: Arasınav
8. hafta: Mikroalglerde Endosimbiyozis ve Parazitlik. Amip ve Flagellatlardaki Simbiyont Bakteriler. Deniz Omurgasızlarındaki Prokaryotik Endosimbiyontları. Metan Okside edebilen bakteriler ile Selülotik Bakterilerin Simbiyozu. Balık Simbiyontu Vibrio fischeri. Archaeae ve Süngerler Arasındaki Simbiyotik İlişki. Ciliatlardaki Simbiyont Bakteriler.
9. hafta: Böceklerde Bakteriyositlerle Bağlantılı Simbiyontları. Afitlerdeki (yaprak bitleri) Endosimbiyontlar. Psyllid Endosimbiyontları. Beyaz Sinek (Whitefly) Endosimbiyontları. Un böcekleri (Mealybug) Endosimbiyontları. Çeçe Sinekleri Endosimbiyontları. Sitophilus (Buğday biti veya pamuk kurdu) Endosymbiontları. Kanatlı karınca Endosimbiyontları. Hamam Böceği ve Termitlerin Endosimbiyontları.
10. hafta: Parlak (luminous) Bakteriler. Aşırı Tuzlu Habitatlarda Yaşayan Bakteriler. Termofilik, psikrofilik ve alkalifilik halofiller. Fototrofik Bakteriler. Magnetotaktik Bakteriler.
11. hafta: Renksiz Sülfür Bakterileri. Asetojenik Bakteriler. Düşük Sıcaklıkta Yaşayabilen Bakteriler.
12. hafta: Bakteri Ekolojisinde Kullanılan Metotlar: Bakteri besini ve büyüme: Büyüme faktörleri, Purinler ve primidinler. Amino asitler, Vitaminler, Besiyeri tipleri. Mikrobiyal büyüme için gerekli olan fiziksel ve kimyasal şartlar. Büyümeye pH Etkisi. Büyümeye Sıcaklığın Etkisi. Bakteri Popülâsyonlarının Artışı. Bakteri Büyümesinin Ölçümü. Hücre Kütlesinin Ölçümü İçin Metotlar. Hücre Sayısının Hesaplanmasında Kullanılan Metotlar. Bakterilerin
13. hafta: Bakterilerin Yaşam siklusları.
14. hafta: Çoğalma Eğrisi. Büyüme Oranı ve üreme Zamanı. Üreme Zamanının Hesaplanması. Bakterilerde Devamlı Kültür. Bakterilerin Eş Zamanlı (Sinkronus) Büyümesi. Büyüme Kontrolü. Sterilizasyon Metotları. Antimikrobiyal Ajanlar. Dünyadaki Kültür Koleksiyonları.
15. hafta*: Genel Değerlendirme
16. hafta*: Final Sınavı
Ders kitapları ve materyaller: Sonay Özkan, 2004. Bakteri Ekolojisi Ders Notları.
Önerilen kaynaklar: 1. Algal Ecology. Freshwater Benthic Ecosystems. Copyright © 1996 Elsevier Inc. Edited by:R. Jan Stevenson, Max L. Bothwell and Rex L. Lowe. ISBN: 978-0-12-668450-6
2. Brock Biology of Microorganisms (13th Edition) [Kindle Edition] . David P. Clark (Author), Michael T. Madigan (Author), John M. Martinko (Author), David A. Stahl (Author)
3. Microbial Ecology of the Oceans (Wiley Series in Ecological and Applied Microbiology) by David L. Kirchman (Jun 23, 2008).
4. Soil microbiology by Selman A. 1888-1973 Waksman (Sep 3, 2011)
5. Bloodborne Airborne Pathogens.McGraw-Hill (Corporate Author). Publication Date: August 2008 | ISBN-10: 0073382884 | ISBN-13: 978-0073382883 | Edition: 2nd.
6. Thermophiles: Biology and Technology at High Temperatures by Frank Robb, Garabed Antranikian, Dennis Grogan and Arnold Driessen (Dec 13, 2007)
  * 15. ve 16. haftalar arası final sınavına hazırlık haftası bulunmaktadır.
Değerlendirme Yukarı
Değerlendirme tipi Hafta numarası Ağırlık (%)
Ara sınavlar (Vizeler): 7 50
Dönem içi diğer çalışmalar: 0
Proje: 0
Ödev: 0
Kısa sınav (Quiz): 0
Final sınavı: 16 50
  Toplam ağırlık:
(%)
   İş yükü Yukarı
Etkinlik Süre (Haftalık saat) Toplam hafta sayısı Dönem boyu toplam iş yükü
Dersler (Yüz yüze öğretme): 3 14
Ders dışı bireysel çalışma: 8 14
Uygulama, Rehberli problem çözme: 0 0
Ödev: 0 0
Dönem projesi: 0 0
Dönem projesi sunumu: 0 0
Kısa sınav (Quiz): 0 0
Ara sınav için bireysel çalışma: 10 1
Ara sınav (Vize): 2 1
Final sınavı için bireysel çalışma: 15 1
Final sınavı: 3 1
    Toplam işyükü:
    Toplam AKTS kredisi:
*
  * AKTS kredisi, toplam iş yükünün 25'e bölümüdür. (1 AKTS = 25 saatlik iş yükü)
-->