• Temel bilgiler
• Öğrenme çıktıları
• İçerik
• Değerlendirme
• İş yükü

Öğrenme çıktıları

Bu dersi başarıyla tamamlayan öğrenciler, şu yetilere sahip olurlar:

1. İnsan mikrobiyotası ve mikrobiyomları hakkında bilgilenmek.

   Program Çıktılarına Katkıları

   1. İleri düzey Biyoloji kavramlarını tanımlamak ve uygulamak
   2. Araştırma projesi doğrultusunda literatürü dikkatlice gözden geçirip, kendi sonuçları ile önceki literatür arasında bağlantı kurmak
   3. Yaşam formları ve çevreleri ile ekosistem arasındaki ilişkileri tanımlamak
   4. Hücre ve organizmalarda yapı-fonksiyon ilişkisini tanımlamak
   5. Genetik ve protein mühendisliği, mikrobik tanımlama, enzim teknolojileri, memeli hücre kültürü ve bitki doku kültüründe kullanılan teknikleri bilmek ve uygulamak
   6. Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği
   7. Bilimsel bilgiye ulaşmak ve bağımsız çalışmak
   8. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak
   9. Araştırma konusu ile ilgili fikir ve bulgularını sözlü ve yazılı olarak etkin şekilde ifade edebilmek
   10. Profesyonel ve etik davranış sorumluluğu sergilemek
   11. Biyolojik kavramları bireysel, sosyal, ekonomik, teknolojik ve etik konulara uygulamak

   Değerlendirme Tipi

   1. Yazılı sınav
   2. Ödev
   3. Seminer/sunum
   4. Dönem projesi
2. İnsan mikrobiyotasında yer alan mikroorganizmaların (Archaeae, bakteri, virus) sebep olduğu hastalıkların tanısı ve tedavisi hakkında bilgilenmek.

   Program Çıktılarına Katkıları

   1. İleri düzey Biyoloji kavramlarını tanımlamak ve uygulamak
   2. Yaşam formları ve çevreleri ile ekosistem arasındaki ilişkileri tanımlamak
   3. Organizma ve popülasyonlardaki genetik aktarımını açıklamak
   4. Bilimsel bilgiye ulaşmak ve bağımsız çalışmak
   5. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak
   6. Araştırma konusu ile ilgili fikir ve bulgularını sözlü ve yazılı olarak etkin şekilde ifade edebilmek
   7. Biyolojik kavramları bireysel, sosyal, ekonomik, teknolojik ve etik konulara uygulamak

   Değerlendirme Tipi

   1. Yazılı sınav
   2. Dönem projesi
3. İnsan mikrobiyomu hakkındaki projeler hakkında bilgilenmek.

   Program Çıktılarına Katkıları

   1. İleri düzey Biyoloji kavramlarını tanımlamak ve uygulamak
   2. Hücre ve organizmalarda yapı-fonksiyon ilişkisini tanımlamak
   3. Genetik ve protein mühendisliği, mikrobik tanımlama, enzim teknolojileri, memeli hücre kültürü ve bitki doku kültüründe kullanılan teknikleri bilmek ve uygulamak
   4. Bilimsel bilgiye ulaşmak ve bağımsız çalışmak
   5. Mevcut bilgiyi geliştirme yöntemleri bulmak
   6. Araştırma konusu ile ilgili fikir ve bulgularını sözlü ve yazılı olarak etkin şekilde ifade edebilmek
   7. Biyolojik kavramları bireysel, sosyal, ekonomik, teknolojik ve etik konulara uygulamak

   Değerlendirme Tipi

   1. Yazılı sınav
   2. Ödev

İçerik
1. hafta:	İnsan mikrobiyomlarının tanımı İnsan mikrobiyotasının anatomik yapısı ve fizyolojik özellikleri
2. hafta:	İnsan mikrobiyom projesindeki son gelişmeler
3. hafta:	İnsan biyotasındaki bakteriyel mikrobiyomlar: Firmicutes Bacteroidetes Proteobacteria Verrumicrobia Actinobacteria Fusobacteria Cyanobacteria Actinomyces viscosus, A. naeslundii Lactobacillus sp. Lactobacillus acidophilus, L. iners, L. crispatus. L. jensenii, L. delbruekii, L. gasseri Staphylococci
4. hafta:	İnsan biyotasındaki Archaea: Methanobrevibacter smithii ve Methanosphaera stadtmanae
5. hafta:	insan biyotasındaki mantar ve mayalar : Candida sp. Malassezia sp.
6. hafta:	insan biyotasındaki viruslar Bacteriyofajlar Human immunodeficiency virus: HIV enfeksiyonu İnsan viruslarının çeşitliliği İnsan viromu Papillomavirus Hijyen hipotezi İnsan mikrobiyomlarına gıdanın etkisi
7. hafta:	Sindirim sistemindeki kronik iltihaplar : IBD (Inflammatory bowel disease) Ulcerative colitis Crohn’s disease
8. hafta:	ARA SINAV
9. hafta:	Insan mikrobiyotasında kanser tipleri Kolorektal kanser Gastirik kanser Özofagus kanseri
10. hafta:	Clostridium difficille enfeksiyonu Helicobacter pylori enfeksiyonu
11. hafta:	Kadınlarda üreme sistemi biyotası ve hastalıkları: Bacterial vaginosis Gastrointestinal sistem bozukluları ile bağlantılı insan mikrobiyotası
12. hafta:	Karaciğer hastalıkları ve insan mikrobiyotası DÖNEM PROJESİ DAĞITIMI
13. hafta:	Metabolik hastalıklar ve insan mikrobiyotası Obezite Tip 2 diyabet
14. hafta:	Mikrobiyota ve allerjik hastalıklar Mikrobiyota ve psikolojik hastalıklar.
15. hafta*:	DÖNEM PROJESİ SUNUMLARI
16. hafta*:	FİNAL SINAVI
Ders kitapları ve materyaller:	Ders notları Her haftanın konusu ile ilgili güncel makaleler
Önerilen kaynaklar:	1.The Human Microbiota and Microbiome, Julian R Marchesi , 14 Mayıs 2014, CABI 2. The Human Microbiome Handbook. Jason Tetro, Emma Allen-Vercoe DEStech Publications, Inc, 15 Mar 2016 - 370 sayfa 3. The Human Microbiome, An Issue of Clinics in Laboratory Medicine, E-Book. Matthew R. Pincus , 12 Kasım 2014 , Elsevier Health Sciences 4. The Human Microbiome: The Germs That Keep You Healthy. Rebecca E. Hirsch 1 Ağustos 2016. Twenty-First Century Books 5. The Human Microbiome. Colin Harwood 17 Kasım 2017. Academic Press 6. The Human Microbiome: Ethical, Legal and Social Concerns. Rosamond Rhodes, Nada Gligorov, Abraham Paul Schwab. Oxford University Press, 15 Ağu 2013 - 288 sayfa 7. Welcome to the Microbiome: Getting to Know the Trillions of Bacteria and Other Microbes In, On, and Around You. Rob DeSalle Susan L. Perkins . 10 Kasım 2015 8. Human Microbiome and Dysbiosis in Clinical Disease: Volume 1: Parts 1 - 4, 2. cilt Alex Vasquez. International College of Human Nutrition & Functional Medicine, 23 May 2015
	* 15. ve 16. haftalar arası final sınavına hazırlık haftası bulunmaktadır.

Değerlendirme
Değerlendirme tipi	Hafta numarası	Ağırlık (%)
Ara sınavlar (Vizeler):	8	20
Dönem içi diğer çalışmalar:		0
Proje:	15	10
Ödev:	4, 5, 6, 9, 10, 12	30
Kısa sınav (Quiz):		0
Final sınavı:	16	40
	Toplam ağırlık:	(%)

İş yükü
Etkinlik	Süre (Haftalık saat)	Toplam hafta sayısı	Dönem boyu toplam iş yükü
Dersler (Yüz yüze öğretme):	3	14
Ders dışı bireysel çalışma:	3	14
Uygulama, Rehberli problem çözme:	0	0
Ödev:	6	14
Dönem projesi:	3	1
Dönem projesi sunumu:	1	1
Kısa sınav (Quiz):	0	0
Ara sınav için bireysel çalışma:	3	1
Ara sınav (Vize):	3	1
Final sınavı için bireysel çalışma:	3	1
Final sınavı:	1	1
		Toplam işyükü:
		Toplam AKTS kredisi:	*
	* AKTS kredisi, toplam iş yükünün 25'e bölümüdür. (1 AKTS = 25 saatlik iş yükü)